Rượu, hút thuốc và căng thẳng — trong cơ thể chịu những tác nhân kích thích này, các tế bào chịu trách nhiệm duy trì sự sống dường như đang chiến đấu với một cuộc chiến không bao giờ kết thúc. Do tình trạng thiếu nhân công trầm trọng, Red Blood Cell AA2153 phải nhanh chóng học cách cung cấp oxy và thu thập carbon dioxide, ngay cả trong điều kiện nguy hiểm. Trong khi đó, White Blood Cell U-1196 phải làm nhiệm vụ của mình bằng cách đối phó với vi trùng và vi rút trong những tình huống nguy hiểm đến tính mạng. Giữa những khủng hoảng này, họ phải làm việc cùng nhau để giữ cho cơ thể khỏe mạnh, mặc dù không biết liệu sự hy sinh của họ có xứng đáng hay không.Hataraku Saibou Black có một cách tiếp cận khác bằng cách cho thấy khía cạnh tàn nhẫn hơn của các công việc mà tế bào của chúng ta thực hiện.