Điệp Vụ Song Sinh gồm những cặp song sinh giống hệt nhau tạo thành và chia làm hai phe thiện và ác. Phe thiện cho người anh trai Thường Trung dẫn đầu và phe ác do người em Thường Dũng dẫn đầu. Phe của Thường Dũng đánh cắp một bảo Cát Tường (Hồng Kim Bảo đóng) và con nuôi Lưu (NgôKinh) mang một chuỗi hạt vô giá, với lời tương truyền về khả năng chữabệnh kỳ diệu tới Hong Kong để triển lãm.
Trên đường đi, họ bị một nhómsát thủ song sinh cướp mất báu vật. Trong khi đó, anh trai sinh đôi củaLưu mắc bệnh hiểm nghèo, cần chuỗi hạt để chữa bệnh. Hai cha con tìm tới cựu hiệu trưởng Trương của Họcviện Song Tử (Nguyên Hoa đóng), nhờ bậc thày võ thuật này hợp sức tìmlại món đồ quý. Ông Trương từng dành tâm huyết cả đời dạy võ cho nhiềucặp sinh đôi – trong đó có chị em Bảo Châu (Thái Trác Nghiên) và BảoNgọc (Chung Hân Đồng) để bảo vệ người vô tội. Từ chối không được, lạithấy Cát Tường bị bọn cướp truy sát, ông đành phải vào cuộc, cùng cáchọc viên truy tìm chuỗi hạt. Đối thủ của họ là những cặp song sinh võnghệ cao cường, lạnh lùng và tàn ác. vật tên Thiên Châu buộc phe thiện của Thường Trung phải tái xuất giang hồ gây nên một cuộc chiến long trời lở đất.